Valentino Rossi de local suma su pole N°65 de su carrera, segundo fue Jorge Lorenzo y tercero Maverick Viñales.
Valentino Rossi fue más rápido de lo que nadie podía esperar. Rossi hizo enloquecer a los miles de aficionados que asistieron a la cita en el Autodromo de Mugello logrando una pole position de récord. El 1:46.208 marcado por Valentino pulverizó el récord que se mantenía desde 2015 de Iannone. Además de volver a cosechar una ‘pole’ para salir desde la primera posición mañana, Rossi consiguió por primera vez este año meterse en primera fila de parrilla.
Jorge Lorenzo y Maverick Viñales completaron la primera fila quedando a menos de una décima del tiempo de ‘Il Dottore’. Mientras Lorenzo -segundo- se quedó a milésimas de lograr la primera ‘pole’ con Ducati, Maverick se metió en primera fila -siendo tercero- tras haber pasado por la Q1. Para Viñales también es la primera vez que logra estar en primera fila esta temporada.
La segunda fila la conforman Iannone, Petrucci y Marc Márquez . El de Cervera tuvo más de algún susto a lo largo de la Q2. El más grande ocurrió en la curva de entrada meta. Marquez volvió a protagonizar una de sus salvadas levantando su moto cuando ya estaba prácticamente besando el asfalto. Iannone siguió siendo regular, como viene siendo a lo largo del fin de semana, mientras Petrucci fue el primer piloto privado.
Resultados de la Clasificación Moto GP Mugello 2018:
| Posición | Piloto | Marca | Tiempo |
| 1 | Valentino Rossi |  Movistar Yamaha MotoGP |
1:46.208 |
| 2 | Jorge Lorenzo |  Ducati Team |
0.035 |
| 3 | Maverick Viñales | Movistar Yamaha MotoGP |
0.096 |
| 4 | Andrea Iannone |  Team Suzuki Ecstar |
0.139 |
| 5 | Danilo Petrucci | 
Alma Pramac Racing |
0.237 |
| 6 | Marc Marquez | 
Repsol Honda Team |
0.246 |
| 7 | Andrea Dovizioso | Ducati Team |
0.292 |
| 8 | Cal Crutchlow |  LCR Honda Castrol |
0.605 |
| 9 | Johann Zarco |  Monster Yamaha Tech 3 |
0.622 |
| 10 | Alex Rins | Team Suzuki Ecstar |
0.701 |